El futbolista procede del UCAM Murcia, club con el que rescindió su contrato recientemente.
La nueva incorporación del Elche CF tiene una amplia experiencia en equipo de Segunda B tras haber militado en el filial del Villarreal, Ontinyent, Mirandés, Alcoyano y UCAM. Ha jugado en Segunda Division con el Castilla, Alcorcón y Guadalajara.
Asimismo, Jony Ñíguez ha disputado partidos también en las primeras divisiones de las ligas portuguesa y eslovena.
El Elche CF es el tercer club de Segunda B por el que firma el jugador esta temporada, ya que en verano fue contratado por el Real Mallorca, con el que tras realizar la pretemporada rompió su compromiso en agosto para firmar por el UCAM.
Jony Ñíguez se convierte en el cuarto futbolista de la familia Ñíguez en vestir la camiseta del Elche tras su padre, Boria, delantero del primer equipo en los años 80 y principios de los 90, y sus hermanos Aarón y Saúl.